Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E9PBE3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E9PBE3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms