Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA8A3KMH1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms