Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms