Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms