Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMED7Q9Y3B3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms