Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBNO2Q9Y2G9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms