Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM35Q9UPQ4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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