Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms