Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms