Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJB4Q9UDY4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms