Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL42Q9P2K6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms