Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms