Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRO2289Q9P1D8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms