Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms