Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms