Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms