Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms