Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms