Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCDHB16Q9NRJ7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms