Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms