Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms