Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms