Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL11BQ9C0K0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms