Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms