Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM8Q9BZR9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms