Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms