Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms