Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSBP4Q9BWG4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms