Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC94Q9BW85 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms