Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms