Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms