Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms