Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NMNAT3Q96T66 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMNAT3Q96T66 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms