Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms