Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms