Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms