Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms