Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms