Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DNAJA3Q96EY1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms