Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms