Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPTQ96BT3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms