Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMIGD2Q96BF3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms