Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms