Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms