Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNBP2Q8WZ74 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNBP2Q8WZ74 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms