Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIPC3Q8TF64 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms