Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFXN5Q8TD22 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFXN5Q8TD22 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms