Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW03

SIAH3, Seven in absentia homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH3Q8IW03 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH3Q8IW03 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms