Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms