Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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